| 年 | 历史沿革 | 书记 | 副书记 | 院长（所长） | 副院长（副所长） |
| 1981.06 | 成立武汉地质学院高等教育研究室 | 主任：李永昇 | 副主任：袁宝华 陶世龙 杨巍然 |
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| 1986.12 | 主任：张人权 | ||||
| 1990.01 | 地矿部高等教育研究室挂靠学校，与学校高等教育研究室合并 | 部研究室常务副主任、学校研究室主任：胡轩魁 | |||
| 1994.10 | 明确为正处级单位 | ||||
| 1995.07 | 副主任：唐嘉耀 |
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| 1997.01 | 主任：张建国 正处级调研员： 方耀华 |
副处级调研员： 江华年 |
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| 1998.01 | 副主任：李正元 |
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| 1998.07 | 主任：梁志 | ||||
| 2001.03 | 成立发展研究中心 （高等教育研究所） |
主任（所长）： 殷鸿福 常务副主任（副所长）：梁志 |
郑启贵 | ||
| 2003.05 | 常务副主任（副所长）：储祖旺 |
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| 2005.02 | 成中梅 | ||||
| 2005.05 | 主任（所长）： 张锦高 |
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| 2007.06 | 李祖超 | ||||
| 2009.01 | 侯志军 | ||||
| 2013.03 | 成立发展规划处（学科建设办公室、高等教育研究所） | ||||
| 2013.04 | 处长（主任、所长）：储祖旺 |
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| 2013.05 | 徐绍红 | ||||
| 2018.07 | 处长（主任、所长）：侯志军 |
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| 2018.11 | 蒋洪池 | ||||
| 2020.05 | 所长：周爱国 | ||||
| 2020.11 | 陈彪 | ||||
| 2021.01 | 高等教育研究所、马克思主义学院心理学研究所联合组建教育研究院 | ||||
| 2021.04 | 成立中共中国地质大学（武汉）教育研究院总支部委员会 | 徐绍红 | 陈彪 | ||
| 2021.06 | 柯佑祥 | 蒋洪池 陈彪 | |||
| 2022.05 | 刘陈陵 |
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